De conformidad con el principio de normatividad, primero debe hacerse valer el recurso que se tenga contemplado para combatir el auto que desecha una prueba (ya sea procedimiento penal, civil o administrativo); dependiendo de como le vaya en el recurso, si le es adverso, puede acudir, ahora sí, al amparo. Saludos!!!

Mientras no agotes el principio de definitividad... No puedes acudir al juicio de amparo... Ahora bien... Negado el amparo y protección de la justicia federal... Te queda el recurso de revisión ... No hay apelación en el Amparo ... Lo que torna definitivo... Y como último dictado en la línea de definitividad de un asunto.. Sea cual fuere su materia y controversia...

Estimada Abogadarosa: A falta de más información, si el desechamiento de prueba es en materia penal o civil, definitivamente y conforme a procedimiento aplicable y vigente en el caso concreto, se debe agotar primeramente el recurso que te establesca la norma procesal en vigor, para posteriormenmte irte al amparo (principo de definitividad). Saludos