Las diferencias son bastantes, pero basicamente el nuevo sistema penal es se rige por los siguientes principios rectores:

1) Oralidad

2) Publicidad

3) Contradicción

4) Concentración

5) Continuidad

6) Inmediación

7) Igualdad

A diferencia del sistema tradicional , las audiencias son orales y públicas, así mismo en el nuevo sistema de Justicia Penal Acusatorio se denomina imado en el sist. tradicional inculpado, ahora deberá ser considerado y tratado como inocente en todas las etapas del proceso, mientras no se declare su culpabilidad por sentencia firme, por lo que ninguna autoridad pública podrá presentar a una persona como culpable, hasta que la sentencia condenatoria haya causado estado, de donde deriva el "Principio de presunción de inocencia", es decir que ahora quien acusa (en este caso el Ministerio Público- fiscal) es en quien recae la carga de la prueba; en tanto que en el sistema tradicional el inculpado tenía que demostrar su inocencia.

Otra diferencia es que el imado deberá ser asistido y defendido por un Licenciado en Derecho o su equivalente autorizado en términos de la Ley, siendo pues, el derecho a la defensa técnica irrenunciable, por lo que la violación a este derecho da como consecuencia la nulidad absoluta de las actuaciones que se realicen a partir de ese momento, en tanto que en el sist. tradicional podía nombrar hasta a una persona de su "confianza" aún cuando dicha persona no tuviese conocimientos en la materia ni mucho menos la profesión. 

De igual forma el principio de igualdad establece que ambas partes son iguales ante el Juzgador y no tendrán ventaja sobre el otro, por lo que el imado tendrá conocimiento de todo lo que integre la Carpeta de Investigación para estar en posibilidad de plantear su defensa, a diferencia del sist. tradicional, que se consignaba la Averiguación Previa y el inculpado no podía tener acceso a todo lo que obrara en esta aduciendo a la secrecia de la Averiguación.

Bueno, estas son algunas de las diferencias espero y le sea de ayuda.

GRACIAS.