...¿Tengo que reconocer y registrar a las criaturas con mi apellido?

si el juez ordena por sentencia ejecutoriada que el reconocimiento de paternidad  por muestra de adn se dio... si... las tienes que poner  a tu nombre... y darles pensión alimenticia...

¿Que posibilidades tengo de que las menores (niñas) se queden conmigo ya que las condiciones en que ella las tiene (condiciones de habitación, higiene, alimentación y ejemplo por su "trabajo") no son las ideales para las niñas?

NINGUNA... el trabajo ...nada tiene que ver con la relación familiar...la IDEALIDAD que señalas sería que las hijas asistieran a ver como se encuera su madre  para aprehender el oficio... solo así..