Juan. Efectivamente las escuelas privadas si tienen regulaciones por parte de la Secretaria de Educacion Publica y  deben estar registradas ante el Gobierno del Estado. No te recomiendo que  presiones  por medio de una Queja en contra de tu Universidad o Director, deberias de llevarlo a un plano conciliatorio, ya sabes que esta de por medio tus estudios. En algunos de los Estados de la Republica existen Centros de Justicia Alternativa y son procedimientos conciliatorios entre las partes hasta que llegan a un acuerdo. Trata de investigar si existe un centro de Justicia Alternativa en tu localidad. Buena Suerte.