Primero debes verificar la legal procedencia de tus escrituras, investiga el tracto sucecivo de la fecha de tu adquiscion hacia atras, hasta encontrar el antecedente mas remoto del inmueble de donde se desprende tu escritura, de ai necesitas verificar si el predio de donde se desprendio tu escritura, realmente salio del dominio de la  nacion y tambien verificar si fue afectado por la resolucion de reconocimiento de la comunidad o dotacion del ejido que mencionas y revisar los planos de la comunidad para ver si se encuentra respetado o afectado dicho predio, asi como verificar topograficamente la correcta ubicacion.  Seguramente en caso de que no accedas iniciaran un juicio garario, acude con un abogado especialista o a la Procuraduria Agraria de tu estado para que te orienten gratuitamente.

Saludos espero te sirva