El acuerdo de separación de cuerpos, es válido, sin embargo la pérdida de derechos de patria potestad sobre sus hijos es algo que no es admisible, puesto que la misma es irrenunciable.

La situación es, usted que desea hacer? Le explico..., la separación de cuerpos o abandono de hogar es causal de divorcio, que en su caso no es aplicable, al no estar casados.

Por otro lado, si ella no quiere saber nada de sus hijos, adelante, sin embargo, vuelvo a reiterar, la patria potestad es irrenunciable.

Si quiere tener a sus hijos, esta bien, que el acuerdo diga que usted tiene la guarda y custodia definitiva de ambos y listo. Con el tiempo, podría promover la pérdida de la patria potestad en contra de la madre de los mismos por alguna de las causales que señale su codigo.

Saludos.