Saludos:

las cuotas del INFONAVIT se pagan por bimestres vencidos,  tu contador debio hacerle semana tras semana la retencion , ahora bien supongamos que se le paso a tu contador realizarle la retencion, es obligacion de tu contador  no es asi, porque no mejor le descuentas a tu contador por menso ?? 

la ley LFT, marca un monto maximo y un plazo para realizar  descuentos, obviamente no puede exceder de ese limite y de ese plazo (si te ajustas a LFT obviemente)