"que si el señor faltaba lo descontaban del porcentaje que le queda"

Me parece que usted responde la cuestión, informese con su abogado el porque de esta situación, que tal como usted dice, si le llegaran a hacer un descuento extraoridonario, debería de ser al porcentaje que se le da al sr. y no restarle al monto fijado de la pensión, es decir, no deben de restar y olver a sacar el 50%, sino del salario que reportaron, al que le sacaron el 50%, a la parte que le queda al señor hacerle los descuentos que la empresa considere.

Chequelo con su abogado, con algún abogado de oficio, o acuda directamente con el juez, mediante un escrito, solicitando una aclaración de esta situación.

Saludos