Hola buen dia.

Lo que usted puede estar viviendo se debe a 2 cosas

A) Que usted este registrado 2 o mas veces.... osea cuenta con 2 actas de nacimiento. Anteriormente los padres registraban por ejemplo en Jalisco y la otra en DF y eso genera dos CURP con exactamente los mismos datos y solo cambian los dos ultimos digitos que son los que diferencian a personas homonimas. 

B) Si usted no tiene 2 actas, significa que.,.. en el año 2000 las CURP podian hacerlas HACIENDA, Las Escuelas, Las Afores, El IMss etc etc -.... y llenaban campos al azar solo les importaba generar un numero de CURP.  Con el tiempo se quito esa posibilidad de llenado y aquellas curp mal llenadas asi se quedaron...entonces al tramitar una curp ahora si con los datos correctos se genera para el sistema una segunda CURP 

Que hacer entonces.... acuda con la copia certificada (la que normalmente se le conoce como original) y copia simple de su acta de nacimiento a la Oficina del Registro Civil mas cercana a su domicilio. Imprima previo desde internet las 2 curps que le aparecen y muestrelas al Registro Civil (Quien es la unica institucion hoy dia que puede hacer algun movimiento a la curp en primera instancia) para que le UNIFIQUEN esas Curp y listo... se gestionara ante RENAPO la unificacion y en un par de dias maximo usted tendrá SOLO una curp

Saludos