Hola consulta, te en materia tributaria usted "no puede darse de baja ya" si no sencillmanete se debe realizar una suspensión de actividades,  antes que nada hay que saber en que regimen la dieron de alta, pues es muy aventurado que su contador le haya hecho esa observación debido a que si a usted no le ha llegado requerimiento de pago alguno por parte del SAT,  usted podrea solamente hacer sus declaraciones en cero, sin embargo como le comento, debera primero acercarse a la tributaria mas cercana a su localidad a efecto de que le expliquen su regimen y su status fical, ahora, tambien usted podría ir a tramitar su clave CIECF a la tributaria y realizar las consultas desde el portal de SAT.  no se deje sorprender.... saludos!