buen dia:

mira , si tus hijas solo llevan tu apellido y en el acta de nacimiento no existe filiacion por linea paterna, es decir no aparece el nombre del padre, entonces tu pareja puede registrarlas como propias, sin necesidad de algun tramite especial, con la sola voluntad de tu pareja, no necesitas casarte con el antes, ni hacer un juicio de adopcion es sencillo solo acudan al registro civil y manifiesten su voluntad, ahora la religion que tu profeses no tiene interferncia con el derecho, no importa si la quieres bautizar o no, eso no es importante, para esta situacion  puesto que no crea derechos legales algunos.