el contratro de comodato es un contrato de prestamo, por lo que deja en desventaja al comodatario que  solo usa el bien a manera de prestamo, ademas de que si vas a poner un negocio vas a necesitar los recibos del arrendamiento para que los puedas deducir de impuestos, por lo que yo te recomiendo que lo que firmes sea un contrato de arrendamiento ya que es la figura jurídica correcta y la que aplica para tu caso ya que no le estas pidiendo que te preste el local se lo estas rentando.

Saludo y mucha suerte