Esta un poco confusa tu consulta, mas lo que te recomiendo es que siempre que realices un pago, exigas un recibo del dinero entregado el cual debe de ir relaicionado con el pagare firmado, es decir, debe mencionar que es pago al documento de fecha tal, firmdo a favor de ..., con vencimiento el.... etc. para que te evites problemas en un futuro.

aunque de preferencia, por que así lo exige la ley, se deben de poner todos los pagos y/o abonos en el propio documento (pagare)