si dices que estas casado con ella, tu de alguna manera participas en la educacion y tutela de la menor puesto que existe un documento de matrimonio, y no existe barrera para que la secretaria de relaciones exteriores te otorgue el pasaporte de la menor pues esta de pormedio la madre....en caso contrario que la madre vaya a el Juzgado de lo Familiar y exponga la ausencia del padre  y la irresponsabilidad de este para con la menor, sobre todo decirle a la autoridad que ella no sabe desde hace mucho tiempo nada del progenitor....

recuerda que padre no es el que enjendra, sino el que educa y mantiene....