Hola que tal, es lamentable la situación por la que tu amistad pasó, en primera se debería denunciar a las personas que golpearon a esta persona ante la Comisión de los Derechos Humanos, por violar sus derechos fundamentales. E intentando dar contestación a tus preguntas: 1.- Para promover un amparo, en este caso necesitas agotar la segunda instancia, una vez dictada sentencia desfavorable en contra, se promueve el amparo directo. Y no te preocupes ya que el amparo no lo conoce el TSJ, sino un juez federal, en este caso un Tribunal Colegiado de Circuito. Por lo que el proceso no esta amañado. 2.- se les da valor probatorio pero no forman prueba plena, es decir, no tienen fuerza o certeza legal. Ni mucho menos por que las pruebas periciales salieron a su favor. 3.- El parte medico es una prueba con mayor certeza legal, por lo que lo podrías usar a tu favor al momento de denunciar ente la Comisión de Derechos Humanos. 4.- ¿auto incriminarse? No es la solución. Lo que si recomiendo ampliamente es que busques a un abogado para que te lleve el asunto e intente resolver el problema. Espero haberte orientado en algo y Suerte.