Estado de Referencia: Chiapas

Registre a mi hija de 9 años cumpliendo con todos los requisitos de ley..  extemporaneamente la niña nacio en chiapas a la edad de 2 años la madre la abandono y me la entrego antes de irse para los usa desconosco su paradero.. a esa edad me la lleve a guatemala de donde soy originario estudio 2 años en la escuela. pero por cuestiones de trabajo y por ser ella mexicana me vine a residir a mexico actualmente estudia 3 año en la escuela aqui en mexico.. adjunte constancia de parto.. constancia de la procuradora del dif donde se especifica que la madre la abandono y que no hay ningun inconveniente en venir a reconocerla.. tengo el acta de nacimiento y certificada curp y demas documentos.. el problema es que solicite el pasaporte de la niña para viajar a centro america a trabajar y no me quieren dar el pasaporte el SRE porque ellos argumentan que esta en duda la nacionalidad de la menor.. yo fui hasta tuxtla con la subdelegada y me menciono que estaba en estudio en el DF la documentacion y que iban a dictaminar si procedia o no para el pasaporte.. y que iban a indagar a la registradora civil porque hizo el acta sin datos de la madre en el acta si soy padre soltero y la procuradora lo especifica.. igual dicen que eso no tiene validez... al final en el registro civil que le van a decir si se cumplio con todos los requisitos... ya eh dado muchas vueltas y gastado bastante en este tema y es muy desgastante que debo hacer ??? la subelegada de la SRE incluso me menciono que podrian anular el acta de nacimiento eso es legal ??? yo le platique sobre el art. 30 y 37 de la constitucion de mexico pero igual le dio.. como que ellos manejan sus propios argumentos internos eso le enendi a la lic.. y que la decision es de ellos.. en enero tengo que viajar a nicaragua ..  me mando a sacar el pasaporte de la menor a guatemala le dije que personalmente siento que se estan dañando los derechos de la niña. y que esa acta para ella no significa nada como demuestro su nacionalidad ??  podre solicitar el pasaporte de la menor en nicaragua ??? la verdad se siente bien feo que lo vean a uno como que hizo algo ilicito es frustrante e indignante... yo lo unico que quiero es que mi hija viaje conmigo ya que es 1 mes a trabajar haya... en la escuela le dan permiso por ese tiempo pruedente.... me dijo que esperara hasta que cumpliera ella los 18 años.. que me pueden asesorar en este caso por favor Dios los bendiga mucho por sus aportes y orientaciones.. adicionalmente me certificaron todo el apendice de nacimiento y el acta del libro original igual les da.. para que ponen esos requisitos si no sirven para nada... gracias espero alguna orientacion