Estado de Referencia: Baja California

Buenas noches mi problema es el siguiente, tengo dos años y medio laborando en una imprenta, solo que no me habian dado de alta en el seguro a principios de año sali embarazada, y le pedi el seguro a mi jefe por cuestiones de que el tenia una serie de multas y ciertos tramites sin resolver en el seguro me vino dando de alta ya que hiba a cumplir los 5 meses, empece a atenderme e ir a mis consultas pero no alcance las semanas cotizadas que pide el seguro por lo tanto me negaron pago de incapacidad, tengo entendido no se si me equivoco que deben pagar el sueldo que ganas integro como si estuvieras trabajando esto es correcto??? y otra duda que tengo el imss te hace el pago en una sola exhibicion en este caso si la incapacidad la paga mi jefe tiene que ser igual en una sola exhibicion o me puede pagar la incapacidad  semanalmente como si estuviera cobrando mi sueldo normal??? estoy un poco confundida ya que ignoro cuanto me tendria que pagar y la forma en que me tendria que pagar  les agradeceria mucho que me orientaran al respecto y si no me quisiera pagar mi sueldo integro hay algo que pudiera hacer o a donde me tendria que dirigir??? saludos!!!