Estado de Referencia: Baja California

Quisiera su orientacion o consejo al respecto de una situacion muy particular en la que me encuentro.

Tengo 10 años trabajando en un centro de atencion psicologica y empece trabajando por honorarios, en 2006 empece a trabajar como coordinadora por lo que se me empezo a pagar un sueldo fijo semanal y desde entonces ha sido sin prestaciones.

Actualmente tengo 30 semanas de embarazo, a mi jefa le comunique mi situacion cuando tenia tan solo 6 semanas de embarazo y exigi una regularizacion de mi sueldo, ya que tengo un sueldo base muy bajo y un porcentaje como comision que compensa bastante mis gastos ya que incluso puede llegar a ser el doble de mi sueldo base, sin embargo se nego ya que cuando yo falte ella tendra que pagar a otra persona para que me cubra.

Mi jefa me dice que ella me pagara la cuarentena que es lo que por ley se paga, pero lei la LFT y dice que son 6 semanas antes y 6 semanas despues, es decir 12 semanas, pero esto es a traves del IMSS

No se como abordar esta situacion con mi jefa puesto que aunque mi trabajo es administrativo y no conlleva riesgo a mi embarazo, yo quiero tomarme el tiempo real que me corresponde para prepararme. 

No se cuanto tendria que pagarme puesto que si me pagara solo mi sueldo base no seria suficiente para cubrir gastos maternales ya que me atiendo por lo privado.

Existe algun articulo en la LFT que se ajuste a mis necesidades?

Cabe aclarar que aunque no me pague utilidades si me paga vacaciones y aguinaldos.

Agradezco la atencion prestada a esto