Estado de Referencia: Chihuahua

mi duda es la siguente yo entre a trabajar estando embarazada entre el 24  de junio y me incapacitaron el 28 de diciembre pero me negaron el pago del subsidio por parte del IMSS por no cumplir las 30 semanas segun mis cuentas me faltaron como 2  semanas o menos, entonces me dijeron que el patron debe pagarme, lo cual ya entregue un papel que me dieron para el patron que tambien me la esta haciendo larga que la otra semana que porque no le autorizan aun el pago,  mi duda es si se sigue cotizando durante el tiempo que estoy incapacitada ya que asi acompletaria las semanas para la segunda incapacidad.  ya que consulte en internet la segunda incapacidad  y me sale que no tengo derecho al pago y como tambien estuve 15 dias antes incapacitada por amenaza de aborto y como fue por enfermedad nose si esos 15 dias no segui cotizando y eso me afecta quitandome 15 dias menos para acompletar las 30 semanas

mis dudas serian se siguen cotizando durante las incapacidades ya sea por embarazo o por enfermedad???????????